Alķīmiķis ir romāns, kas rakstīts divās daļās, un epilogs. Tas griežas ap Andalūzijas ganu vārdā Santjago un viņa personīgās leģendas meklējumus, kas viņu ved no sava ciema uz Ēģiptes piramīdām. Savos ceļojumos viņš satiekas ar virkni personāžu, kuri vai nu tieši viņam palīdz, vai māca viņam vērtīgu mācību, izmantojot piemēru.
Melhisedeks un alķīmiķis kļūst par mentoriem, savukārt angļi sniedz piemēru tam, kas notiek, ja jūs cerat iegūt zināšanas galvenokārt no grāmatām, un kristālu tirgotājs parāda viņam dzīves veidu, ja cilvēks neievēro personīgo Leģenda. Alķīmiķis ir noteikts Visumā, kur katrai būtnei ir sava Personīgā leģenda un kur pasaulei ir dvēsele, kurai ir kopīgs viss, sākot no dzīvām būtnēm un beidzot ar rupju matēriju.
Pirmā daļa
Santjago ir jauns gans no Andalūzijas un priecājas par gaidāmo ceļojumu uz pilsētu, kur viņš bija pavadījis iepriekšējo gadu, jo bija ticies ar meiteni, kuru viņa aizrāva. Viņa ir komersanta, kurš no viņa pērk vilnu, meita, cilvēks ar uzticības jautājumiem, kurš prasa, lai Santjago viņa priekšā aitas cirptu, lai izvairītos no jebkādas krāpšanas. Viņš guļ pamestā baznīcā, kur viņam ir atkārtots sapnis, kurā redzamas piramīdas. Kad viņš to izskaidro čigānietei, viņa to saprot diezgan taisnīgi, sakot, ka viņam patiešām jābrauc uz Ēģipti, lai atrastu apbedītu dārgumu. Sākumā viņš vilcinās, jo viņš bauda savu dzīvi kā gans, un viņam nācās pretrunā ar vecāku gribu to turpināt, jo viņi gribēja, lai viņš kļūst par priesteri.
Pēc tam viņš nonāk pie veca cilvēka, kurš tiek dēvēts par Melhisedeku, kurš izskaidro “Personiskās leģendas” jēdzienu, kas ir personīgais piepildījums, kuru ikvienam ir pienākums sasniegt. Tas ir "tas, ko jūs vienmēr esat gribējuši paveikt. Ikviens, būdams jauns, zina, kas ir viņu personīgā leģenda. "Viņš saka, ka, lai atrastu savu dārgumu, un viņš dod viņam divus burvju akmeņus, Urimu un Thumimimu, kuri atbild “jā” un “nē” uz jautājumiem, uz kuriem viņš nevar atrast atbildi pats.
Pēc savas aitas pārdošanas Santjago to nosūta Tangeram, bet, kad viņš tur nonācis, visu naudu viņš aplaupījis cilvēks, kurš viņam bija teicis, ka viņš varētu viņu nogādāt piramīdās. Tas viņu pārāk neuzbudina, jo viņš sāk strādāt pie kristālu tirgotāja, patiesībā atbalstot darba devēja biznesu ar savām gudrajām idejām. Kristālu tirgotājam bija pašam personīga leģenda - svētceļojums uz Meku, bet viņš no tā atteicās.
Otrā daļa
Tiklīdz Santjago nopelna pietiekami daudz naudas, viņš nav pārliecināts, kā rīkoties. Ir pagājuši vienpadsmit mēneši, un viņš nav pārliecināts, vai viņam vajadzētu atgriezties Andalūzijā, lai nopirktu aitas ar saviem ienākumiem, vai turpināt savus meklējumus. Galu galā viņš pievienojas treileram, lai ceļotu uz piramīdām. Tur viņš tiekas ar līdzbraucēju, kas pazīstams kā anglis, kurš apkauno alķīmiju. Viņš dodas uz Al-Fayoum oāzi, lai satiktu alķīmiķi, jo viņš cer iemācīties jebkuru metālu pārvērst zeltā. Ceļojot tuksnesī, Santjago iemācās sazināties ar pasaules dvēseli.
Tuksnešos sāk karot, tāpēc karavāna pagaidām paliek oāzē. Santjago nolemj palīdzēt angļiem atrast alķīmiķi. Viņu informācijas avots ir Fatima, meitene, ar kuru viņš satiekas, kad viņa savāc ūdeni no akas un ar kuru viņš tūlīt iemīlas. Viņš ierosina viņai apprecēties, un viņa piekrīt, ja viņš pabeidz savus meklējumus. Viņa ir “tuksneša sieviete”, kas prot lasīt omenes un zina, ka pirms atgriešanās visiem ir jāpamet.
Pēc izlaišanas tuksnesī Santjago ir redzējums - divi vanagi uzbrūk viens otram, par uzbrukušo oāzi. Uzbrukšana oāzei ir tuksneša noteikumu pārkāpums, tāpēc viņš to attiecina uz virsniekiem, taču viņi saka, ka viņam būs jāmaksā ar savu dzīvību, ja oāze nebeigsies ar uzbrukumu. Drīz pēc šī redzējuma viņš satiekas ar svešinieku, kas valkā melnus tērpus, sēžot virs balta zirga, kurš atklājas, ka ir alķīmiķis.
Oāze uzbrūk, un, pateicoties Santjago brīdinājumam, iemītnieki spēj pieveikt jātniekus. Tas nepaliek nepamanīts alķīmiķim, kurš, savukārt, nolemj konsultēt Santjago un palīdzēt viņam sasniegt piramīdas. Tomēr tos drīz tuvojas cita karavīru grupa tuksnesī. Alķīmiķis saka Santjago, ka, lai viņš varētu progresēt ceļojumā, viņam jākļūst par vēju.
Arvien vairāk iepazīstot pasaules dvēseli, Santjago koncentrējas tuksnesī un galu galā izdodas kļūt par vēju. Tas biedē sagūstītājus, kuri nekavējoties atbrīvo viņu un alķīmiķi.
Viņi to nogādā klosterī, kur alķīmiķis daļu svina pārvērš zeltā un sadala to. Viņa ceļojums šeit apstājas, jo viņam ir jāatgriežas oāzē, bet Santjago dodas tālāk un galu galā sasniedz piramīdas. Viņš sāk rakt tajā vietā, kur sapņoja par sava dārguma atrašanu, bet viņu satrauc reidi un veic smagu piekaušanu. Viens no reideriem, vaicājot par to, ko Santjago tur darīja, apvaino viņu sapņa dēļ, pieminot, ka viņam bija sapnis par dārgumiem, ko apglabāja pamesta baznīca Spānijā, un ka viņš nebija pietiekami stulbs, lai vajātu tā.
Epilogs
Tas dod Santjago atbildi, kuru viņš meklēja. Kad viņš atgriežas baznīcā Spānijā, viņš nekavējoties izraida dārgumus, atceras, ka ir parādā daļu no tā čigānietei un nolemj atkal apvienoties ar Fatimu.