Pat visvienkāršākie dzīvnieki uz zemes ir ārkārtīgi sarežģīti - un no tiem sastāv uzlaboti mugurkaulnieki, piemēram, putni un zīdītāji tik daudzas dziļi savstarpēji saistītas, savstarpēji atkarīgas kustīgās daļas, ka amatieriem, kas nav biologi, var būt grūti izsekot viņiem. Zemāk ir 12 orgānu sistēmas, kuras kopīgi izmanto lielākā daļa augstākie dzīvnieki, ieskaitot elpošanas sistēmu un integrālo sistēmu.
Nepieciešamas visas šūnas skābeklis, izšķiroša sastāvdaļa enerģijas ieguvei no organiskiem savienojumiem. Dzīvnieki skābekli no apkārtējās vides iegūst ar savu elpošanas sistēmu: sauszemes mugurkaulnieku plaušas savāc skābekli no gaisa, okeānā dzīvojoši mugurkaulnieki filtrē skābekli no ūdens, un bezmugurkaulnieku eksoskeleti veicina brīvu skābekļa (no ūdens vai gaisa) difūziju viņu ķermeņi. Dzīvnieku elpošanas sistēmas izdala arī oglekļa dioksīdu - vielmaiņas procesu atkritumus, kas būtu nāvējoši, ja tos uzkrātu ķermenī.
Mugurkaulnieki piegādā šūnām skābekli caur asinsrites sistēmām, kas ir artērijas, vēnas un kapilāri, kas pārvadā skābekli saturošas asins šūnas uz katru šūnu šūnā ķermeņi. (Asinsrites asinsrites sistēmas
bezmugurkaulnieki ir daudz primitīvāki; būtībā viņu asinis brīvi izkliedējas pa daudz mazākiem ķermeņa dobumiem.) Asinsrites sistēma augstākos dzīvniekus darbina sirds, blīva muskuļu masa, kas miljoniem reižu pārspēj visu radību mūžs.Nervu sistēma ir tā, kas dzīvniekiem ļauj sūtīt, saņemt un apstrādāt nervu un maņu impulsus, kā arī pārvietot muskuļus. Mugurkaulniekiem šo sistēmu var iedalīt trīs galvenajos komponentos: centrālā nervu sistēma (kurā ietilpst smadzenes un muguras smadzenes), perifērā nervu sistēma (mazākie nervi kas atdalās no muguras smadzenēm un nes nervu signālus uz attāliem muskuļiem un dziedzeriem) un autonomo nervu sistēmu (kas kontrolē tādas piespiedu aktivitātes kā sirdsdarbība un gremošana). Zīdītāji piemīt vismodernākās nervu sistēmas, savukārt bezmugurkaulniekiem ir daudz nerimtīgas nervu sistēmas.
Dzīvniekiem ir jāsadala ēdamais ēdiens tā galvenajos komponentos, lai veicinātu metabolismu. Bezmugurkaulniekiem ir vienkārša gremošanas sistēma - vienā galā, otrā (kā tārpu vai kukaiņu gadījumā), bet visi mugurkaulnieki ir aprīkoti ar dažas mutes, rīkles, kuņģa, zarnu un anālo atveri vai kloaku, kā arī orgānu (piemēram, aknu un aizkuņģa dziedzera), kas izdala gremošanas sistēmu, kombinācija fermenti. Atgremotāju zīdītājiem, piemēram, govīm, ir četri kuņģi, lai efektīvi sagremotu šķiedrainus augus.
Augstākiem dzīvniekiem endokrīno sistēmu veido dziedzeri (piemēram, vairogdziedzeris un aizkrūts dziedzeris) un hormoni šie dziedzeri izdalās, kas ietekmē vai kontrolē dažādas ķermeņa funkcijas (ieskaitot metabolismu, augšanu un reprodukcija). Var būt grūti pilnībā norīt endokrīno sistēmu no citām mugurkaulnieku orgānu sistēmām: piemēram, sēkliniekiem un olnīcām (kas ir cieši iesaistīti reproduktīvajā sistēmā) ir tehniski dziedzeri, tāpat kā aizkuņģa dziedzeris, kas ir būtiska gremošanas sistēmas sastāvdaļa sistēma.
Neapšaubāmi vissvarīgākā orgānu sistēma no evolūcijas perspektīvas, reproduktīvā sistēma ļauj dzīvniekiem radīt pēcnācējus. Bezmugurkaulniekiem ir raksturīga plaša reproduktīvās izturēšanās spektrs, taču būtība ir tāda (dažos gadījumos punkts procesa laikā) mātītes izveido olas, un tēviņi apaugļo olas vai nu iekšēji, vai ārēji. Visi mugurkaulnieki - no plkst zivis uz rāpuļi cilvēkiem - dzimumdziedzeri, pārī savienoti orgāni, kas veido spermu (vīriešiem) un olšūnas (sievietēm). Lielāko mugurkaulnieku tēviņi ir aprīkoti ar dzimumlocekļiem, bet mātītes - ar vagīnām, piena izdalīšanas sprauslām un dzemdēm, kurās augļiem ir ģenētiskas saites.
Limfātiskā sistēma, kas ir cieši saistīta ar asinsrites sistēmu, sastāv no visa ķermeņa limfmezglu tīkla, kas izdala un cirkulē dzidrs šķidrums, ko sauc par limfu (kas praktiski ir identisks asinīm, izņemot to, ka tajā nav sarkano asins šūnu un tajā ir neliels pārpalikums balto asiņu šūnas). Limfātiskā sistēma ir sastopama tikai augstākos mugurkaulniekos, un tai ir divas galvenās funkcijas: uzturēt asinsrites sistēmu, kas tiek piegādāta ar asins plazmas sastāvdaļu, un uzturēt imūnsistēmu. (Apakšējos mugurkaulniekos un bezmugurkaulniekos asinis un limfas parasti tiek kombinētas, un tās nevada divas atsevišķas sistēmas.)
Muskuļi ir audi, kas dzīvniekiem ļauj gan kustēties, gan kontrolēt viņu kustības. Ir trīs galvenās muskuļu sistēmas sastāvdaļas: skeleta muskuļi (kas ļauj augstākiem mugurkaulniekiem staigāt, skriet, peldēt un satvert priekšmeti ar rokām vai spīlēm), gludie muskuļi (kas ir iesaistīti elpošanā un gremošanā un nav apzināti kontrolēti); un sirds vai sirds muskuļi, kas darbina asinsrites sistēmu. (Dažiem bezmugurkaulniekiem, piemēram, sūkļiem, pilnībā trūkst muskuļu audu, bet tie joprojām var pārvietoties, pateicoties to saraušanai epitēlija šūnas).
Iespējams, ka vissarežģītākā un tehniski modernākā no visām šeit uzskaitītajām sistēmām imūnsistēma ir atbildīga par dzīvnieka vietējo audu atšķiršanu no svešķermeņiem. un patogēni, piemēram, vīrusi, baktērijas un parazīti, kā arī imūnās atbildes mobilizēšanai, ar kuru palīdzību ķermenis ražo dažādas šūnas, olbaltumvielas un fermentus, lai iznīcinātu iebrucējiem. Galvenais imūnsistēmas nesējs ir limfātiskā sistēma; abas šīs sistēmas lielākā vai mazākā mērā pastāv tikai mugurkaulniekiem un ir visattīstītākās zīdītājiem.
Augstāka līmeņa dzīvnieki sastāv no triljoniem diferencētu šūnu, un tāpēc viņiem ir vajadzīgs kāds veids, kā saglabāt to strukturālo integritāti. Daudziem bezmugurkaulniekiem (piemēram, kukaiņiem un vēžveidīgajiem) ir ķermeņa ārējie apvalki, kas pazīstami arī kā eksoskeleti, kas sastāv no hitīna un citiem stingriem proteīniem; haizivis un stari kopā tur ar skrimšļiem; un mugurkaulniekus atbalsta iekšējie skeleti, kas pazīstami arī kā endoskeleti, kas izveidoti no kalcija un dažādiem organiskiem audiem. Daudziem bezmugurkaulniekiem pilnīgi trūkst jebkāda veida endoskeleta vai eksoskeleta; liecinieks mīlīgs medūzas, sūkļi un tārpi.
Visi sauszemes mugurkaulnieki ražo amonjaku, kas ir gremošanas procesa blakusprodukts. Zīdītājiem un abiniekiem šis amonjaks tiek pārvērsts par urīnvielu, apstrādāts caur nierēm, sajaukts ar ūdeni un izdalīts kā urīns. Interesanti, ka putni un rāpuļi izdala urīnvielu cietā veidā kopā ar citiem atkritumiem - šiem dzīvniekiem tehniski ir urīnceļu sistēmas, bet neražo šķidru urīnu - kamēr zivis izvada amonjaku tieši no ķermeņa, vispirms to nepārvēršot urīnvielā.
Integrālo sistēmu veido āda un struktūras vai izaugumi, kas to pārklāj (spalvas putnu, zivju svari, zīdītāju mati utt.), kā arī spīles, naglas, nagi un tamlīdzīgi. Acīmredzamākā integrētās sistēmas funkcija ir aizsargāt dzīvniekus no viņu vides apdraudējumiem, taču tā ir arī neaizstājama temperatūras regulēšanai (matu vai spalvu pārklājums palīdz saglabāt ķermeņa iekšējo siltumu), aizsardzībai pret plēsējiem (resnais apvalks bruņurupucis padara to par smagu uzkodu krokodiliem), izjūt sāpes un spiedienu un cilvēkiem rada pat tādas svarīgas bioķīmiskas vielas kā vitamīns D.