Sēnītes ir eikariotu organismi, tāpat kā augi un dzīvnieki. Atšķirībā no augiem, tie nedarbojas fotosintēze un viņu šūnu sienās ir hitīns, glikozes atvasinājums. Tāpat kā dzīvnieki, arī sēnītes ir heterotrofi, kas nozīmē, ka viņi saņem barības vielas, absorbējot tos.
Lai gan lielākā daļa cilvēku domā, ka viena atšķirība starp dzīvniekiem un sēnītēm ir tā, ka sēnītes ir nekustīgas, dažas sēnes ir kustīgas. Īstā atšķirība ir tā, ka sēnīšu šūnu sienās ir molekula, ko sauc par beta-glikānu - šķiedras veidu.
Lai arī visām sēnēm ir dažas kopīgas pazīmes, tās var iedalīt grupās. Tomēr zinātnieki, kuri pēta sēnes (mikologi), nav vienisprātis par labāko taksonomisko struktūru. Vienkārša nespeciālista klasifikācija ir sadalīt tos sēnēs, raugā un veidnēs. Zinātnieki mēdz atpazīt septiņas sēņu subdomas vai filu.
Agrāk sēnītes klasificēja pēc to fizioloģijas, formas un krāsas. Mūsdienu sistēmas paļaujas uz molekulāro ģenētiku un reproduktīvajām stratēģijām, lai tās grupētu. Paturiet prātā, ka šīs phyla nav ieraktas akmenī. Mikologi pat nepiekrīt sugu nosaukumiem
Vispazīstamākās sēnes, iespējams, pieder pie subdomdom Dikarya, kas ietver visas sēnes, lielāko daļu patogēnu, raugu un pelējuma. Subkingdom Dikarya ir sadalīts divās phyla, Ascomycota un Basidiomikota. Šīs phyla un pārējās piecas, kas tika ierosinātas, ir diferencētas, pamatojoties galvenokārt uz seksuāli reproduktīvajām struktūrām.
Lielākais sēnīšu daudzums ir Ascomycota. Šīs sēnes sauc par askomicītēm jeb sac sēnēm, jo to meiotiskās sporas (askosporas) ir atrodamas maisiņā, ko sauc par ascus. Šajā patvērumā ietilpst vienšūnu raugi, ķērpji, pelējuma formas, trifeles, daudzas šķiedrainas sēnes un dažas sēnes. Šis patvērums veicina sēnītes, ko izmanto alus, maizes, siera un zāļu pagatavošanai. Piemēri ietver Aspergillus un Penicilijs.
Kluba sēnītes jeb basidiomycetes, kas pieder pie patvēruma Basidiomikota ražot bazidiosporas uz kluba formas struktūrām, ko sauc par bazidijām. Patvērumā ietilpst visbiežāk sastopamās sēnes, dīgļu sēnes un rūsas. Daudzi labības patogēni pieder pie šī patvēruma. Cryptococcus neoformans ir oportūnistisks cilvēka parazīts. Ustilago maydis ir kukurūzas patogēns.
Sēnītes, kas pieder pie patvēruma Chytridiomycota sauc par chytrids. Tās ir viena no nedaudzajām sēņu grupām ar aktīvu kustīgumu, veidojot sporas, kas pārvietojas, izmantojot vienu flagellum. Chytrids iegūst barības vielas, noārdot hitīnu un keratīnu. Daži no tiem ir parazīti. Piemēri ietver Batrachochytrium dendobatidis, kas abiniekiem izraisa infekcijas slimību, ko sauc par chtridiomycosis.
Stjuarts, S. N.; Šansons Dž. S.; un citi. (2004). "Abinieku skaita samazināšanās un izzušanas statuss un tendences visā pasaulē." Zinātne. 306 (5702): 1783–1786.
Patvēruma biedri Blastocladiomycota ir chytrids tuvi radinieki. Faktiski tika uzskatīts, ka tie pieder pie patvēruma, pirms molekulārie dati lika viņiem kļūt atsevišķi. Blastocladiomycetes ir saprotrofi, kas barojas ar sadalīšanās organisko materiālu, piemēram, ziedputekšņiem un hitīnu. Daži no tiem ir citu eikariotu parazīti. Kamēr chytrids spēj veikt zigotisko meiozi, blastocladiomycetes veic sporic meiosis. Patvēruma izstādes dalībnieki paaudžu maiņa.
Piemēri ir Allomyces macrogynus, Blastocladiella emersonii, un Physoderma maydis.
Patvērums Mikrosporidija satur sēnītes, kas veido sporas veidojošus vienšūnu parazītus. Šie parazīti inficē dzīvniekus un protistus - vienšūnu organismu. Cilvēkiem infekciju sauc par mikrosporidiozi. Sēnītes reproducējas saimnieka šūnā un atbrīvo šūnas. Atšķirībā no vairuma eikariotu šūnu, mikrosporīdijās trūkst mitohondriju. Enerģija tiek ražota struktūrās, kuras sauc par mitosomām. Mikrosporīdijas nav kustīgas.
Neocallimastigomycetes pieder pie patvēruma Neocallimastigomycota, neliels anaerobo sēnīšu daudzums. Šiem organismiem trūkst mitohondriju. Tā vietā viņu šūnas satur hidrogenosomas. Tie veido kustīgas zoospores, kurām ir viena vai vairākas flagellas. Šīs sēnes ir sastopamas vidē, kas bagāta ar celulozi, piemēram, zālēdāju gremošanas sistēmās vai atkritumu poligonos. Tie ir atrasti arī cilvēkiem. Atgremotāju sēnītēm ir būtiska loma šķiedrvielu sagremošanā.
Citi organismi izskatās un darbojas līdzīgi sēnītēm, tomēr nav valstības locekļi. Gļotu veidnes neuzskata par sēnītēm, jo tām ne vienmēr ir šūnas siena un tāpēc, ka tās uzņem barības vielas, nevis absorbē tās. Ūdens pelējumi un hipohihidrīdi ir citi organismi, kas izskatās pēc sēnītēm, taču tos vairs neklasificē.