Balasta ūdens apstrāde ar jaunākajām tehnoloģijām var atbilst standartiem ar ātrumu 2500 kubikmetru (660,430 ASV galonu) stundā. Lielam kuģim joprojām var būt vajadzīgas vairākas stundas vienā apmaiņā, lai ar šādu ātrumu izskalotu balasta tvertnes.
Pirmais, balasta ūdens apmaiņa, ir balstīts uz noteiktiem attālumiem un dziļumiem, no kuriem kuģis var izplūst.
Dažās jomās tiek ieviesti standarti, kas pārsniedz SJO pamatnostādnes. Gan Kalifornija, gan Lielo ezeru reģions ASV ir pieņēmuši stingras vietējās vadlīnijas. ASV ir viena no daudzām lielākajām kuģniecības valstīm, kas nav parakstījušas konvenciju.
Balasta ūdens apmaiņas gadījumā kuģu operatori neiztīrītu balastu izskalo no tvertnēm. Tas ir praktisks, ja ne ideāls veids, kā ļaut vecākiem kuģiem darboties bez balasta ūdens attīrīšanas modernizēšanas izdevumiem un loģistikas problēmām.
Jauni un modernizēti kuģi balasta ūdens dēļ daudz mazāk pārvadā nevēlamas sugas apstrādes sistēmas lielu daļu dzīvotspējīgo organismu iepriekš izvada no balasta tvertnēm izlāde.
Ūdens, kas apstrādāts atbilstoši šim standartam, tiek uzskatīts par pietiekami tīru, lai tas izplūst lielākajā daļā ostu. Šīs darbības balasta ūdens atkārtotai starpniecībai ir efektīvas tikai nevēlamo organismu izvadīšanai. Joprojām ir iespējams pārvadāt toksīnus, piemēram, varu un smagos metālus, kas bieži atrodas ostās, uz citiem galamērķa punktiem balasta ūdenī, un šie piesārņotāji var koncentrēties balasta tvertnes nogulumos. Radioaktīvās vielas var pārvadāt arī balastā, bet visus nopietnos gadījumus, visticamāk, ātri atradīs uzraudzības personāls.