Masīvkoka vai lapu koki var kaitēt vai nogalināt slimību izraisošie organismi, ko sauc par patogēniem. Visvairāk parastās koku slimības izraisa sēnītes. Sēnēm trūkst hlorofila un barojas ar (parazitējošiem) kokiem. Daudzas sēnes ir mikroskopiskas, bet dažas ir redzamas sēņu vai gliemežu formā. Arī dažas koku slimības izraisa baktērijas un vīrusi. Patogēni var inficēt daudzas dažādas koku sugas ar līdzīgiem slimības simptomiem. Šeit es vēlos uzrunāt šādus jautājumus:
Miltrasa ir izplatīta slimība, kas uz lapu virsmas parādās kā balta pulverveida viela. Tas uzbrūk visu veidu kokiem. Koki, kurus visbiežāk ietekmē miltrasa, ir liepas, krabis, katalpa un chokecherry, bet gandrīz jebkurš koks vai krūms var iegūt miltrasu.
Kvēpu pelējuma slimība var rasties uz jebkura koka, bet visbiežāk tā tiek novērota bokseris, goba, liepa un kļava. Patogēni ir tumšas sēnītes, kas aug vai nu uz medusrasas, kas izdalās ar nepieredzējušiem kukaiņiem, vai uz izspiesta materiāla, kas nāk no noteiktu koku lapām.
Bieži sastopama augsnes izraisīta slimība, ko sauc par Verticillium alboatrum, iekļūst kokā caur saknēm un izraisa lapu vīstīšanos. Gaišas krāsas lapas ar blāvu izskatu ir pamanāmas vasaras sākumā. Pēc tam lapas sāk nomest. Vislielākās briesmas ir īpaši jutīgiem kokiem, piemēram, kļavai, katalpei, gobai un kaulaugļiem.
Terminu "rūsa" slimība lieto, lai aprakstītu nokauto vietu inficētā koka mizā, zarā vai stumbrā. Desmitiem sugu sēnīšu izraisa rūkoņa slimības.
Sirdu puves slimību dzīvos kokos izraisa sēnītes, kas iekļuvušas kokā caur vaļējām brūcēm un pakļautas plikai koksnei. Parasti konkuļa vai sēņu "augļojošs" ķermenis ir pirmās infekcijas pazīmes. Visi lapu koki var iegūt sirds puvi.