Ūdens kopienas ir galvenie ūdens biotopi pasaulē. Patīk zemes biomi, ūdens kopienas var arī sadalīt, pamatojoties uz kopīgām pazīmēm. Divi izplatīti apzīmējumi ir saldūdens un jūras kopienas.
Saldūdens kopienas
Upes un strauti ir ūdenstilpes, kas nepārtraukti pārvietojas vienā virzienā. Abas ir strauji mainīgas kopienas. Upes vai strauta avots parasti ievērojami atšķiras no vietas, kurā upe vai straume iztukšojas. Šajās saldūdens kopienās var atrast dažādus augus un dzīvniekus, ieskaitot foreles, aļģes, zilaļģes, sēnītes, un, protams, dažādas zivju sugas.
Estuāri ir apgabali, kur saldūdens straumes vai upes satiekas ar okeānu. Šajos ļoti ražīgajos reģionos ir ļoti atšķirīga augu un dzīvnieku dzīve. Upe vai straume parasti satur daudz barības vielu no iekšzemes avotiem, padarot estuārus spējīgus atbalstīt šo bagātīgo daudzveidību un augsto produktivitāti. Estuāri ir dažādu dzīvnieku, tostarp ūdensputnu, barošanas un vairošanās vietas rāpuļi, zīdītāji, un abinieki.
Ezeri un dīķi ir stāvošas ūdenstilpes. Daudzas straumes un upes beidzas ezeros un dīķos. Fitoplanktons parasti atrodas augšējos slāņos. Tā kā gaisma tiek absorbēta tikai noteiktos dziļumos,
fotosintēze ir izplatīta tikai augšējos slāņos. Ezeri un dīķi atbalsta arī dažādu augu un dzīvnieku dzīvi, ieskaitot mazas zivis, garneles sālījumā, ūdens kukaiņus un daudzas augu sugas.Jūras kopienas
Okeāni pārklāj aptuveni 70% no zemes virsmas. Jūras kopienas ir grūti sadalīt atšķirīgos tipos, bet tās var klasificēt, ņemot vērā gaismas iekļūšanas pakāpi. Vienkāršākā klasifikācija sastāv no divām atšķirīgām zonām: fotoniski un afotiski zonas. Fotiskā zona ir gaismas zona vai apgabals no ūdens virsmas līdz dziļumam, kurā gaismas intensitāte ir tikai aptuveni 1 procents no gaismas virsmas. Šajā zonā notiek fotosintēze. Lielākā daļa jūras dzīvību pastāv fototiskajā zonā. Apotiskā zona ir teritorija, kurā saules starojums tiek saņemts maz vai nav. Vide šajā zonā ir ārkārtīgi tumša un auksta. Organismi, kas dzīvo afotiskajā zonā, bieži ir bioluminiscējoši vai ir ekstremofili un lietpratīgi, dzīvojot ekstremālā vidē. Tāpat kā citās kopienās, okeānā dzīvo dažādi organismi. Daži no tiem ir sēnītes, sūkļi, jūras zvaigzne, jūras anemones, zivis, krabji, dinoflagellates, zaļās aļģes, jūras zīdītāji, un milzu brūnaļģes.