Kāda ir atšķirība starp pārakmeņojušos un pārakmeņoto? Tas var nedaudz mulsināt. A fosilijas ir jebkādas dzīvības liecības, kas saglabājušās klintīs. Fosilijās ietilpst ne tikai paši organismi, bet arī urvas, zīmes un pēdas, kuras viņi atstājuši. Fosilizācija ir nosaukums vairākiem procesiem, kas rada fosilijas. Viens no šiem procesiem ir minerālu aizstāšana. Tas ir izplatīts nogulumiežu un dažos metamorfos iežos, kur minerālu graudus var aizstāt ar materiālu ar atšķirīgu sastāvu, bet tomēr saglabājot sākotnējo formu.
Kad fosilo organismu tiek pakļauts minerālu aizstāšanai, tiek teikts pārakmeņojies. Piemēram, pārakmeņotu koksni var aizstāt ar halcedonu vai čaumalas aizvietot ar pirītu. Tas nozīmē, ka no visām fosilijām tikai pati būtne varētu tikt fosilizēta pārakmeņošanās.
Zinātnieki vārdu "pārakmeņojušies" nelieto daudz. Ko mēs saucam par pārakmeņojušos koku, viņi drīzāk sauc par fosilo koksni. Bet "pārakmeņotajam" ir patīkama skaņa. Tas izklausās pēc fosilijas kaut kam pazīstamam, kas izskatās dzīvesveidīgs (piemēram, koka stumbrs).