siRNS, kas apzīmē mazas traucējošās ribonukleīnskābes, ir divslāņu RNS molekulu klase. To dažreiz sauc par īsu traucējošu RNS vai klusējošu RNS.
Mazi traucējoši RNS (siRNS) ir mazi divpavedienu (ds) RNS gabali, parasti apmēram 21 nukleotīdu garumā, ar 3 '(izteikti trīskārtīgi) pārkari (divi nukleotīdi) katrā galā, ko var izmantot, lai "traucētu" olbaltumvielu translāciju, saistoties ar kurjeru RNS (mRNS) un veicinot to sadalīšanos specifiskos sekvences.
siRNA funkcija
Pirms ienirt tajā, kas tieši ir siRNA (nedrīkst sajaukt ar miRNA), ir svarīgi zināt RNS funkcijas. Ribonukleīnskābe (RNS) ir nukleīnskābe, kas atrodas visās dzīvās šūnas un darbojas kā kurjers, kas nes instrukcijas no DNS, lai kontrolētu DNS sintēzi olbaltumvielas.
Vīrusos RNS un DNS var pārnēsāt informāciju.
To darot, siRNAs novērš specifisku olbaltumvielu ražošanu, pamatojoties uz to atbilstošās mRNS nukleotīdu sekvencēm. Procesu sauc par RNS traucējumiem (RNAi), un to var dēvēt arī par siRNA klusēšanu vai siRNA notriekšanu.
No kurienes viņi nāk
SiRNA parasti tiek uzskatīts par nākušu no garākām eksogēnu augošām dzīslām vai no organisma ārpuses (RNS, ko uzņem šūna un kas tiek tālāk apstrādāta).
RNS bieži nāk no pārnēsātāji, piemēram, vīrusi vai transposoni (gēns, kas var mainīt pozīcijas genomā). Tika konstatēts, ka tiem ir nozīme pretvīrusu aizsardzībā, pārmērīgi ražotas mRNS vai mRNS degradācijā, kuru translācija ir pārtraukta, vai novēršot genomātiskās DNS traucējumus, ko rada transposoni.
Katrā siRNS virknē ir 5 '(piecu prime) fosfātu grupa un 3' hidroksil (OH) grupa. Tos ražo no dsRNS vai matadata cilpas RNS, kas pēc iekļūšanas šūnā tiek sadalīta ar RNāzei III līdzīgu enzīmu, ko sauc par Dicer, izmantojot RNāzi vai restrikcijas fermenti.
Pēc tam siRNS tiek iekļauts vairāku apakšvienību olbaltumvielu kompleksā, ko sauc par RNAi izraisītu klusināšanas kompleksu (RISC). RISC "meklē" piemērotu mērķa mRNS, kur siRNS pēc tam pārtop un, domājams, antisens virkne vada mRNS komplementārās virknes sadalīšanos, izmantojot endo- un eksonukleāzes kombināciju fermenti.
Medicīniskā un terapeitiskā lietošana
Kad zīdītāja šūna saskaras ar divpavedienu RNS, piemēram, siRNS, tā var kļūdaini to iegūt kā vīrusa blakusproduktu un izraisīt imūno reakciju. Turklāt siRNS ieviešana var izraisīt neparedzētu mērķauditorijas atlasi, kur var uzbrukt un izsist arī citus neapdraudošos proteīnus.
Ievadot organismā pārāk daudz siRNS, iedzimtas imūnās atbildes dēļ var rasties nespecifiski notikumi aktivizēšana, bet, ņemot vērā spēju pārspēt jebkuru interesējošu gēnu, siRNAs ir potenciāls daudziem terapeitiskiem nolūkiem.
Daudzas slimības var potenciāli ārstēt, kavējot gēnu ekspresiju, ķīmiski modificējot siRNS, lai uzlabotu to terapeitiskās īpašības. Daži īpašumi, kurus varētu uzlabot, ir:
- Pastiprināta aktivitāte
- Palielināta seruma stabilitāte un mazāk mērķu
- Samazināta imunoloģiskā aktivācija
Tāpēc sintētiskās siRNS projektēšana terapeitiskām vajadzībām ir kļuvusi par daudzu biofarmācijas firmu populāru mērķi.
Detalizēta visu šādu ķīmisko modifikāciju datu bāze tiek manuāli izstrādāta vietnē siRNAmod, manuāli izstrādāta, eksperimentāli apstiprinātu ķīmiski modificētu siRNA datu bāze.