Molekulārie savienojumi satur divus vai vairāk nemetāli (nevis amonija jonu). Parasti jūs varat atpazīt molekulāru savienojumu, jo pirmais elements savienojuma nosaukumā ir metāls. Daži molekulāri savienojumi satur ūdeņradi, tomēr, ja redzat savienojumu, kas sākas ar burtu “H”, varat pieņemt, ka tā ir skābe, nevis molekulārs savienojums. Savienojumus, kas sastāv tikai no oglekļa un ūdeņraža, sauc par ogļūdeņražiem. Ogļūdeņražiem ir sava īpaša nomenklatūra, tāpēc tos apstrādā atšķirīgi no citiem molekulāriem savienojumiem.
Nemetāliski var kombinēties dažādās attiecībās, tāpēc ir svarīgi, lai molekulārā savienojuma nosaukums norādītu, cik daudz atomu ir katra veida elementā, kas atrodas savienojumā. Tas tiek paveikts, izmantojot prefiksus. Ja ir tikai viens pirmā elementa atoms, prefiksu neizmanto. Ir ierasts prefiksēt otrā elementa viena atoma nosaukumu ar mono-. Piemēram, CO sauc nevis par oglekļa oksīdu, bet gan par oglekļa monoksīdu.
Kovalenta savienojuma formulu var uzrakstīt no tā nosaukuma, uzrakstot pirmā un otrā elementa simbolus un pārtulkojot prefiksus apakšrakstos. Piemēram, ksenona heksafluorīds tiks uzrakstīts XF
6. Parasti studentiem ir grūtības formulēt formulas no savienojumu nosaukumiem, jo jonu savienojumi un kovalenti savienojumi bieži tiek sajaukti. Jūs nesabalansējat kovalento savienojumu lādus; ja savienojumā nav metāla, nemēģiniet to līdzsvarot!